x

全部频道

> 正文

新软件精准快速识别和定位蛋白质-尊龙app

2023-05-19 08:19

来源标题:新软件精准快速识别和定位蛋白质

冷冻电子断层成像(cryo-et)是一种提供细胞环境和封闭生物分子的详细三维(3d)图像的强大技术。由德国马克斯·普朗克分子生理学研究所研究团队开发的一种软件tomotwin,可在拥挤的细胞中挑选蛋白质。基于深度度量学习的这款新开源工具,使科学家能以高精度和高通量定位几种蛋白质,而无需每次手动创建或重新训练网络。相关论文发表在最近的《自然·方法》杂志上。

tomotwin软件克服了许多现有工具的障碍:它学会在断层图像中挑选形状相似的分子,并将它们映射到几何空间。在学习过程中,它将相似的蛋白质放置在彼此附近的系统会得到奖励,否则会受到惩罚。

该软件为直接在细胞环境中自动识别和定位蛋白质铺平了道路,扩大了cryo-et的潜力。cryo-et有可能破译生物分子在细胞内的工作,并进一步揭示生命的基础和疾病的起源。

在tomotwin软件生成的新图谱中,研究人员可分离并准确识别不同的蛋白质,利用这一点来定位它们在细胞内的位置。此外,该软件的一个优势是,通过取消训练步骤,甚至可在本地计算机上运行。

目前,该软件可在细胞中定位大于15万道尔顿的球状蛋白质或蛋白质复合体。未来,研究团队的目标是定位膜蛋白、丝状蛋白和较小尺寸的蛋白。

责任编辑:郑涛(qv0003)作者:张佳欣

热点排行

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10

频道推荐

北京
文旅
国际
中国
娱乐

北京千龙新闻网络传播有限责任公司尊龙app的版权所有 未经千龙新闻网书面特别授权,请勿转载或建立镜像,违者依法必究新出网证(京)字013号 增值电信业务经营许可证 2-2-1-2004139 跨地区增值电信业务许可证

信息网络传播视听节目许可证0104056号 互联网新闻信息服务许可证11120180003号 京公网安备 11000002000007号

分享到:
网站地图